飲料機械設備內部無菌環境的建立和維持，在無菌水沖瓶、無菌物料灌裝和封蓋設備上，根據不同區域的潔凈度要求，設置不同的空氣正壓，即潔凈度要求高區域的空氣壓力大于潔凈度要求低的區域，使可能有污染的空氣不會進入高潔凈度要求的無菌空間。

   包裝物的無菌處理。目前用于無菌灌裝瓶子的殺菌方法有：噴淋法、噴霧法和灌注法。由于國內廠家較難將瓶子的初始染菌程度控制到較低的指標，所以選用殺菌可靠性較高的灌注法對瓶子內部進行滅菌處理，瓶身外部采取噴淋法沖洗殺菌，并在殺菌保持時間上留有充分的余地，可以確保達到商業滅菌要求。